P1. Estrutura do DNA e RNA. Cromossomas, cromatina e nucleossoma.
P2. Replicação do DNA
P3. Mutações e mecanismos de reparação do DNA.
P4. Recombinação genética.
P5. Transcrição e processamento do RNA.
P6. Tradução do mRNA.
P7. Regulação da expressão genética

1. Introdução à Estatística e à Bioestatística.
2. Estatística descritiva
3. Variáveis Aleatórias
4. Inferência estatística
5. Correlação e Regressão

1. Introdução ao metabolismo
2. Metabolismo glicídico
   2.1. Regulação do metabolismo glicídico
3. Ciclo do ácido cítrico e ciclo do glioxilato
   3.1. Regulação do metabolismo do ciclo do ácido cítrico e do ciclo do glioxilato
4. Fosforilação oxidativa
   4.1. Regulação da fosforilação oxidativa.
5. Fotossíntese
6. Metabolismo dos ácidos gordos
   6.1. Regulação do metabolismo dos ácidos gordos
7. Metabolismo das proteínas

1. Enquadramento: A Biotecnologia e a Engenharia Bioprocessual
2. Bioreatores
   2.1. Estequiometria e cinética dos processos microbianos
   2.2. Geometrias-tipo e modos de operação em bioreatores;
   2.3. Mistura e Agitação; Transferência de massa, de calor e esterilização
   2.4. Scale up e Scale down
3. Processos de Biosseparação
4. Biocatálise
   4.1. Cinética enzimática
   4.2. Enzimas e biocatalisadores celulares e Métodos de imobilização.
   4.3. Biocatálise em meios não-convencionais.

[P1.] Introdução: âmbito da microbiologia aplicada à Biotecnologia; microbiologia industrial versus biotecnologia
[P2.] Grupos de microrganismos com maior importância na microbiologia industrial/biotecnologia
[P3.] Requisitos básicos dos microrganismos: meios de cultura; fontes de carbono e azoto; matérias primas alternativas.
[P4.] Processos fermentativos; upstream e downstream processisng.
[P5.] A microbiologia como ferramenta em diferentes áreas da biotecnologia: alimentar, ambiental, industrial, marinha.

1. Introdução à engenharia genética
2. Vetores
3. Enzimas em engenharia genética
   3.1. Enzimas de restrição, endo e exonucleases, classificação e modos de ação
   3.2. DNases, Rnases, metilases, phosphatases, quinases, ligases
4. Hibridação, amplificação e sequenciação de DNA
   4.1. Métodos de deteção de DNA, reação em cadeia da polimerase (PCR), variações da PCR e suas aplicações
   4.2. Métodos de hibridação de ácidos nucleicos.
5. Construção de bibliotecas de DNA
   5.1. Isolamento, purificação e quantificação de DNA, isolamento de plasmídeos
   5.2. Construção de bibliotecas de cDNA e DNA genómico
6. Técnicas de transferência de genes
   6.1. Técnicas de transferências de genes em plantas (transferência de genes mediadas por Agrobacterium e vírus de
   plantas), animais e microrganismos
   6.2. Transformação, electroporação, microprojeteis
7. Aplicações
   7.1. Biotecnologia microbiana
   7.2. Terapia de genes

1. Poluição e contaminação
2. Avaliação de risco ambiental
3. Conceitos fundamentais
4. Biorremediação.
5. Aplicações biotecnológicas com vista a processos sustentáveis.
6. Métodos de tratamento de efluentes líquidos e gasosos e de resíduos.
7. Legislação ambiental e de gestão de resíduos.

1. Conceitos introdutórios de Biotecnologia Alimentar. Evolução da Biotecnologia na indústria alimentar
2. Microrganismos envolvidos nas fermentações alimentares.
3. Processos fermentativos dos alimentos
   3.2 Utilização de leveduras
   3.3 Utilização de bactérias
4. Análise sensorial
5. Alimentos funcionais
6. Aplicação e produção de enzimas na indústria alimentar.
7. Tecnologias de produção e aplicação de organismos geneticamente modificados (OGM).

1 – Conceitos fundamentais e áreas de aplicação da Biotecnologia farmacêutica.
2 – Linhas de investigação fundamentais na Biotecnologia farmacêutica.
2.1 Produção de moléculas terapêuticas recombinantes: pequenas moléculas e produtos naturais, hormonas e
citocinas, enzimas.
2.2 Anticorpos monoclonais (terapêuticos e de diagnóstico) e vacinas.
2.3 Terapia génica e celular.
2.4 Biomateriais e engenharia de tecidos.
2.5 Aplicação em diagnóstico.
3 – Desenvolvimento industrial, processo de produção e validação de novos biofármacos. Biossíntese de fármacos por
fermentação e por bio-transformação.
4 – Considerações legislativas e económicas. Perspectivas futuras

1. Microbiologia marinha
   1.1 Introdução à microbiologia marinha
   1.2 Métodos em microbiologia marinha
   1.3 Fisiologia de microrganismos marinhos
   1.4 Função dos microrganismos nos processos oceânicos
   1.5 Genómica dos microrganismos marinhos
2. Bioprospecção marinha
   2.1 Isolamento de produtos naturais marinhos
   2.2 Compostos bioativos e biomateriais do ambiente marinhos
   2.3 Ensaios para deteção de enzimas e moléculas bioativas
3. Crescimento sustentável de organismos marinhos
   3.1 Cultivo de microalgas e de macroalgas
   3.2 Cultivo de outros organismos marinhos

P1. Bases de dados biológicos.
P2. Introdução aos algoritmos em bioinformática.
P3. Alinhamento de sequências, alinhamento simples, alinhamento múltiplo.
P4. Filogenia
P4. Predição de motivos e estrutura de proteínas.
P5. Predição de genes e anotação genómica.
P6. Análise da expressão genética

1. Introdução à imunologia. Células e órgãos do sistema imunitário.
2. Células T e células B: seleção, maturação e ativação.
3. Mecanismos específicos e não específicos de defesa.
   3.1.Resposta inflamatória. Sistema do complemento. Interferão.
   3.2.Imunidade celular e imunidade humoral.
4. Complexo major de histocompatibilidade: hereditariedade, processamento e apresentação antigénica.
5. Imunização.
6. Fisiopatologia do sistema imunitário: saúde e doença.
   6.1.Mediadores de inflamação e anti-inflamatórios.
   6.2.Tolerância, hipersensibilidades e autoimunidade; Imunodeficiências.
   6.3. Transplantação e base imunológica da rejeição.
   6.4.Cancro e sistema imunitário.
   6.5.Imunomodulação e imunoterapia.
7. Antigénios e imunogénios.

1. Princípios base da cultura de células e tecidos animais.
   2.Técnicas de assepsia e métodos de esterilização. Métodos de base na cultura de células e tecidos: meio de cultura,
   subcultura, viabilidade celular.
   3.Cultura de células e tecidos animais: Biologia das células animais: metabolismo; adesão; proliferação;
   diferenciação. Cultura primária, subculturas e linhas celulares. Equipamentos e meios de cultura. Criopreservação de
   células animais. Métodos experimentais: viabilidade celular; proliferação celular; Apoptose. Engenharia de tecidos.
2. Células estaminais
3. Células multirresistentes a fármacos: modelo utilizado para testar novos fármacos
4. Modelos animais para indução de tecidos tumorais.

1. Princípios base da cultura de células e tecidos vegetais: perspetiva histórica e métodos de estudo em biotecnologia
   vegetal.
2. A cultura in vitro de plantas: totipotência e competência; multiplicação vegetativa, reguladores de crescimento,
   meios de cultura e condições ambientais de cultura. Clonagem de plantas – propagação de meristemas e
   organogénese: tipos de meristemas, objetivos e limitações.
3. Suspensões celulares e embriogénese somática: tipos de embriogénese, fases e indução. Embriogénese polínica e
   obtenção de haploides. Suspensões celulares e produção de metabolitos secundários. Protoplastos e hibridação
   somática.
4. Manipulação genética e melhoramento de plantas. Plantas geneticamente modificadas.

1. Processos e produtos de algas marinhas
2. Biomateriais
3. Biossensores
4. Biomarcadores
5. Biocombustíveis
6. Aplicações em biorremediação
7. Intervenções biotecnológicas em aquacultura

1. Bioética
2. Comunicação em Ciência
3. Empreendedorismo em Biotecnologia
4. Propriedade Intelectual
5. Carreiras científicas
6. Programas de apoio nacionais e europeus
7. Enquadramento regulamentar e normativo
8. Organização de visita de estudo, palestra ou workshop científico

1. Seleção de tema e equipa de trabalho
2. Pesquisa e design experimental
3. Desenvolvimento do trabalho laboratorial
4. Análise e tratamento de resultados
5. Apresentação e discussão pública do trabalho desenvolvido

Projeto

1. Pesquisa e atualização do estado da arte sobre o tema proposto 1.1.Pesquisa bibliográfica de trabalhos de
   determinada área da biotecnologia
   1.2.Realização de uma monografia sobre o estado da arte de determinada área da biotecnologia 2.Planeamento e elaboração de um projeto científico em Biotecnologia
   2.1. Definição das hipóteses de trabalho
   2.2. Elaboração do planeamento das etapas a desenvolver no projeto 2.3.Organização do trabalho laboratorial
   2.4. Apresentação da fase inicial e preliminar do projeto científico sob a forma de seminários.
   2.5. Elaboração do projeto experimental.
   2.6. Apresentação dos resultados preliminares do projeto científico sob a forma de seminário.
2. Escrita de relatório final.
   3.1. Escrita de relatório escrito com devida estrutura/formatação e discussão dos resultados obtidos face o atual
   estado da arte.
3. Apresentação e discussão final do projeto
   4.1. Defesa e discussão do relatório escrito e apresentação oral do trabalho elaborado

Estágio

As Áreas/Funções elegíveis para a realização de estágio são todas as relacionadas com as temáticas da Biotecnologia
abordadas nas restantes unidades curriculares da licenciatura e que se enquadradem nos requisitos do regulamento
de estágios curriculares e extracurriculares da ESTM (Regulamento nº1087/2016).
Adequando a cada empresa específica, o registo/participação nas tarefas deverá dar atenção aos seguintes aspetos:

1. Pesquisa e atualização do estado da arte sobre o temaproposto no plano de trabalho.
2. Exigências, desafios e aspetos particulares do âmbito das atividades desempenhadas
3. Elaboração do relatório