1. A Química da vida
   1.1. Elementos químicos necessários à vida
   1.2. Estrutura e função das macromoléculas: definição de polímero, hidratos de carbono, lípidos, proteínas, ácidos
   nucleicos
   1.3. A água: Efeitos da polaridade; dissociação das moléculas de água
2. A célula
   2.1. Teoria celular, evolução da célula.
   2.2. Organização celular: Células procarióticas e células eucarióticas: animais e vegetais.
   2.3. Organelos: Sistema endomembranar e outros organelos membranares; citoesqueleto.
   2.4. O núcleo: organização funcional, cromatina e cromossomas, replicação de DNA genómico, nucléolo e ribossomas.
   2.5. Estrutura e função da membrana: modelo de mosaico fluido; superfície celular e junções intercelulares, transporte
   membranar; proteínas transportadoras e transporte ativo
   2.6. Comunicação celular.

1. A ligação química.
2. Forças intermoleculares de sólidos, líquidos e gases.
3. Cinética Química:
4. Fundamentos de Termoquímica
5. Equilíbrio Químico:
6. Ácidos e bases.
7. Conceitos de eletroquímica.

1. Funções reais de várias variáveis reais
2. Cálculo diferencial em Rn
   2.1. Derivadas parciais
   2.2. Extremos de funções de duas variáveis
3. Primitivas e Integrais
   3.1. Definição de primitiva
   3.2. Propriedades das primitivas
   3.3. Métodos de primitivação
   3.4. Definição e propriedades dos integrais definidos
   3.5. Teorema fundamental do cálculo integral
   3.6. Integrais Duplos

P1 Preparação de soluções.
P2 Planeamento de uma Análise Química
P3 Erros associados aos principais métodos de análise
P4 Extração sólido-líquido e líquido-líquido
P5 Centrifugação e filtração
P6 Destilação
P7 Técnicas de concentração
P8 Precipitação
P9 Volumetrias
P10 Métodos Espectroscópicos
P11 Métodos Electroanalíticos
P12 Métodos Cromatográficos

1. Biodiversidade: conceito, ameaças e preservação
2. História da Terra e evolução dos organismos
3. Critérios gerais de classificação dos seres vivos e regras de nomenclatura
4. Caracterização do Subdomínio Protista: Reinos Archaezoa, Euglenozoa, Alveolata, Chlorophyta, Choanoflagellata
5. Caracterização do Reino Metazoa: Filos Porifera, Cnidaria, Ctenophora, Platyhelminthes, Rotifera, Nematoda,
   Mollusca (Classes Caudofoveata, Solenosgastres, Monoplacophora, Polyplacophora, Gastropoda, Bivalvia,
   Cephalopoda), Anellida (Classes Polychaeta, Oligochaeta, Hirudinea), Arthropoda [Subfilos Trilobita, Chelicerata
   (Classes Merostomata, Pycnogonida e Arachnida), Crustacea [Classes Maxillopoda (Subclasses Copepoda e
   Cirripedia), Malacostraca (Ordens Isopoda, Amphipoda, Decapoda, Euphausiacea)], Urinamia (Classes Chilopoda,
   Diplopoda, Insecta)], Echinodermata (Classes Asteroidea, Ophiuroidea, Echinoidea, Holothuroidea, Crinoidea),
   Chordata (Subfilos Urochordata, Cephalochordata)

1. Introdução à etologia, princípios e fundamentos;
2. Definições e conceitos de bem-estar em peixes
3. Comportamento, mecanismos de aprendizagem;
4. Avaliação do bem-estar animal.

1. Introdução aos organismos fotossintéticos marinhos
   1.1. Características gerais
   1.2. Filogenia dos organismos fotossintéticos marinhos
   1.3. Graus de diferenciação e níveis de organização: Organismos unicelulares e pluricelulares; Organização do talo
   das algas; organização do talo das briófitas;
   1.4. Biologia da reprodução: Reprodução vegetativa; Reprodução assexuada; Reprodução sexuada; Alternância de
   gerações; Ciclos de vida haplóide, diplóide e haplo-diplóide.
   1.5. Ecologia dos organismos fotossintéticos.
2. Classificação dos organismos fotossintéticos
   2.1. Domínio Eubacteria
   2.1.1. Divisão Cyanobacteria
   2.2. Domínio Eukaria
   2.2.1. Divisão Dinoflagellata
   2.2.2. Divisão Cryptophyta
   2.2.3. Divisão Haptophyta
   2.2.4. Divisão Heterokontophyta
   2.2.5. Divisão Rhodophyta
   2.2.6. Divisão Chlorophyta
   2.2.7. Divisão Bryophyta
   2.2.8. Divisão Trachaeophyta

1. Introdução
   1.1. Grandezas e unidades.
   1.2. Escalares e vetores.
2. Mecânica Clássica
   2.1. Cinética; Movimento uni e bidimensional, movimento circular.
   2.2. Dinâmica: Leis de Newton; força gravítica, de maré, de atrito e inerciais.
   2.3. Trabalho e Energia: potência, energia cinética e potencial.
3. Mecânica de Fluidos
   3.1. Hidrostática: Princípio de Pascal e de Arquimedes, tensão superficial.
   3.2. Dinâmica de fluidos; Conservação de massa e energia, viscosidade, número de Reynolds, perdas de carga
   localizadas e contínuas, diagrama de Moody, bombas centrifugas.
4. Termodinâmica
   4.1. Lei zero da termodinâmica, temperatura, equilíbrio térmico;
   4.2. Primeira lei da termodinâmica; Energia interna, calorimetria, transferência de calor.
   4.3. Segunda lei da termodinâmica; Conversão calor/ trabalho; Ciclo de Carnot e entropia.
5. Noções de Eletricidade e Magnetismo
   5.1. Campo Elétrico, corrente contínua, lei de Ohm.
   5.2. Campo eletromagnético, corrente alternada, energia renovável.

1. Definição de histologia e conceitos associados
2. Procedimentos usados para análise de amostras histológicas
3. Tipos de tecidos animais: características, propriedades e funções
   3.1. Tecido epitelial:
   3.1.1. Propriedades especiais das células epiteliais
   3.1.2. Tecidos epiteliais de revestimento e glandulares
   3.1.3. Pele e anexos
   3.2. Tecido conjuntivo:
   3.2.1. Caracterização das células, matriz e fibras
   3.2.2. Caracterização de tipos de tecidos conjuntivos especiais:
   3.3. Tecido muscular
   3.3.1. Caracterização das diferentes células: estriadas esqueléticas, estriadas cardíacas e lisas
   3.3.2. Modelo dos filamentos deslizantes na contração muscular
   3.4. Tecido nervoso
   3.4.1. Neurónio, células da glia e estruturas anexas
   3.4.2. Fibras nervosas
4. Definição de embriologia e conceitos associados
   4.1. Processos decorrentes em embriologia: gametogénese, fertilização, segmentação, gastrulação, neurulação e
   organogénese
   4.2. Embriologia comparativa em Invertebrados e Vertebrados

1. Alcanos e Cicloalcanos
2. Alcenos e cicloalcenos
3. Alcinos
4. Hidrocarbonetos aromáticos
5. Haletos de alquilo:
6. Álcoois
7. Éteres e Epóxidos
8. Aldeídos e Cetonas
9. Ácidos Carboxílicos

1. Diversidade e características gerais dos Cordados Vertebrados: Peixes, Anfíbios, Répteis, Aves e Mamíferos
   1.1. Origem
   1.2. Evolução
   1.3. Ecologia
   1.4. Biogeografia
   1.5. Características adaptativas e comportamentais

1. Introdução à biologia de campo
   1.1. Saúde e segurança
   1.2. Procedimentos básicos de trabalho de campo
2. Definição dos objetos e hipóteses de trabalho
   2.1. Método científico
   2.2. Amostragem
   2.3. Organização de dados
3. Métodos em Biologia de campo
4. Estudo de Ambientes aquáticos
   4.1. Metodologias de estudo da fauna e flora (fito e zooplâncton, macrófitas, aves aquáticas e processos biológicos)
   4.2. Metodologias de estudo da flora e fauna de costas rochosas (macroalgas e invertebrados)
   4.3. Sistemas estuarinos, incluindo a dinâmica de nutrientes
   4.4. Metodologias e técnicas de caracterização ecotoxicológica in situ
5. Ambientes terrestres:
   5.1. Metodologias para controlo de erosão costeira: papel das plantas na dinâmica e estabilidade dunar
   5.2. Metodologias de estudo da flora
   5.3. Metodologias e técnicas de estudo de populações de aves (anilhagem, técnicas de censo)
6. Elaboração e comunicação de resultados
   6.1. Comunicação em ciência

1. Introdução à Ecologia
2. Os Organismos e o Ambiente Marinho
   2.1 A importância do ambiente físico sobre os organismos
   2.3 Interações bióticas
   2.4 Fluxo de matéria e energia
   2.5 Ciclos biogeoquímicos e os compartimentos marinhos
3. Ecologia das zonas costeiras
   3.1 Praias rochosas
   3.2 Praias arenosas
   3.3 Estuários
   3.4 Sapais e Mangais
4. Ecossistemas Pelágicos
   4.1 Características físico-químicas do ambiente pelágico
   4.2 Comunidades planctónicas
   4.3 Nécton e pleuston
5. Ecossistemas Bentónicos da Plataforma Continental
   5.1 Características físico-químicas do ambiente bentónico
   5.2.Florestas de Algas Castanhas
   5.3 Recifes de Coral
   5.4 Pradarias Marinhas
6. O Fundo Oceânico Profundo
   6.1 Condições ambientais dos mares profundos
   6.2 Disponibilidade alimentar
   6.3 Comunidades biológicas e vias energéticas
   6.4 As Fontes Hidrotermais como ecossistemas
7. Impactos humanos no Ambiente Marinho

P1. Estrutura do DNA e RNA. Cromossomas, cromatina e nucleossoma.
P2. Replicação do DNA
P3. Mutações e mecanismos de reparação do DNA.
P4. Recombinação genética.
P5. Transcrição e processamento do RNA.
P6. Tradução do mRNA.
P7. Regulação da expressão genética.

1. Introdução
   1.1. Conceito e âmbito da Bioquímica
   1.2. Revisão de fundamentos celulares, físico-químicos e moleculares com interesse em Bioquímica
   1.3. Evolução Bioquímica
   1.4. Água
2. Proteínas
   2.1. Aminoácidos
   2.2. Estrutura e Função das proteínas
   2.3. Purificação e caracterização de proteínas
   2.4. Introdução ao catabolismo de aminoácidos
3. Ácidos Nucleicos
   3.1. Estrutura do ADN e do ARN
   3.2. Replicação do ADN
   3.3. Síntese e processamento do ARN
   3.4. Síntese proteica
4. Enzimas
   4.1. Conceito de energia livre
   4.2. Cinética de Michaelis-Menten
   4.3. Inibição enzimática. Mecanismo funcional de algumas enzimas
   4.4. Regulação da atividade enzimática
5. Glícidos
   5.1. Monossacarídeos, oligossacarídeos e polissacarídeos
   5.2. Glicolípidos e glicoproteínas
   5.3. Introdução ao catabolismo de glícidos
6. Lípidos
   6.1. Ácidos gordos e acilgliceróis
   6.2. Fosfolípidos. Esteróis
   6.3. Introdução ao catabolismo de lípidos

[P1] Estatística Descritiva Univariada: objetivos e principais métodos
[P2] Correlação e Regressão Linear Simples
[P3] Variáveis aleatórias: Parâmetros das variáveis aleatórias; Principais distribuições discretas; Principais
distribuições contínuas
[P4] Inferência Estatística: Intervalos de confiança; Testes de hipóteses; Análises de Variância de efeitos fixos: os
modelos a um e a vários fatores, sem e com interações
[P5] Conceitos de delineamento experimental: Conceção lógica de experiências: das observações à interpretação de
experiências; Problemas em experiências mal delineadas: falta de replicação, falta de controlos, pseudo-replicação no
espaço e no tempo, experiências confundidas, falta de independência

[P1.] Microorganismos no ambiente marinho
[P2.] Factores químicos e físicos no ambiente marinho
[P3.] Habitats microbianos marinhos
[P4.] Métodos usados em Microbiologia Marinha
[P5.] Estrutura dos procariotas marinhos
[P6.] Fisiologia dos procariotas marinhos
[P7.] Bactérias marinhas
[P8.] Archaeas marinhas
[P9.] Microorganismos eucarióticos marinhos
[P10.] Vírus marinhos
[P11.] O papel dos microrganismos nos processos oceânicos. Abordagem microbiológica no estudo do ciclo do
carbono no oceano, das bombas de carbono e da produtividade oceânica.

1. Conceitos introdutórios. Caracterização do setor a nível nacional e internacional
2. Bioprospeção de recursos marinhos
3. Microrganismos de origem marinha e produção de enzimas industriais a partir de isolados marinhos. Compostos
   bioativos
4. Potencial Biotecnológico das Algas Marinhas: aplicações e produção sustentável de macro e microalgas para
   produção de compostos bioativos
5. Utilização de enzimas de origem marinha no processamento de alimentos
6. Novas fontes marinhas de nutracêuticos e alimentos funcionais: macro e microalgas
7. Produtos farmacêuticos de origem marinha: anticancerígenos, antioxidantes e antimicrobianos. Produtos
   cosméticos, pigmentos e compostos com atividade anti-UV provenientes de organismos marinhos
8. Biomateriais de aplicação em medicina regenerativa (quitosano e fucoidano)
9. Biofertilizantes e estimulantes do crescimento vegetal de origem marinha
10. Obtenção de organismos marinhos geneticamente modificados e suas aplicações

M1) A importância das pescas no panorama nacional e internacional
M2) Identificação e caracterização dos principais recursos pesqueiros: peixes & invertebrados: crustáceos, moluscos
e equinodermes
M3) Caracterização bio ecológica: estratégias reprodutivas e histórias de vida
M4) Métodos para identificação de stocks
M5) Dinâmica populacional de um recurso pesqueiro
M6) Efeitos das pescas nas populações e nas comunidades; vulnerabilidade às pescas:
M6.1) Métodos e artes de pesca – técnicas de pesca ativas e passivas
M6.2) Seletividade das artes de pesca e modelos de seletividade

1. História e Ciência dos Oceanos
2. Bacias oceânicas
3. Sedimentos oceânicos
4. Propriedades físico-químicas da água e dos oceanos
5. Circulação da atmosfera e dos oceanos
6. Ondas
7. Marés
8. A Costa: praias e processos costeiros
9. O habitat marinho
10. O plâncton das águas superficiais

C 1. Introdução à Fisiologia Animal
C 2. Equilíbrio Iónico e Osmótico
2.1 Problemas de osmorregulação
2.2 Trocas obrigatórias de iões e água
2.3 Osmorreguladores e osmoconformes
2.4 Osmorregulação no ambiente aquático
C 3. O Sistema Circulatório
3.1 Tipos de sistemas circulatórios
3.2 Sistemas circulatórios dos Vertebrados
3.3 Mecanismos do fluxo sanguíneo
3.4 Circulação nos invertebrados
C 4. O Sistema Respiratório
4.1 O2 e CO2 no sangue
4.2 Transferências gasosas na água
4.3 Transferências gasosas no ar
4.4 Respostas respiratórias a condições extremas
C 5. Nutrição Animal
5.1 Requisitos nutricionais
5.2 Formas de alimentação
5.3 Processamento dos alimentos
5.4 Sistemas alimentares
C 6. Utilização da Energia
6.1 Taxa metabólica e armazenamento de energia
6.2 Efeito da concentração de O2
6.3 Taxa metabólica e tamanho corporal
6.4 Custos energéticos da locomoção
C 7. Efeitos da Temperatura nos Animais
7.1 Trocas de calor entre o animal e o ambiente
7.2 Termorregulação

1. Ambiente e conservação
2. A Origem da questão ambiental à escala global.
3. As grandes conferências mundiais sobre ambiente e biodiversidade
4. Origem e evolução da questão ambiental em Portugal.
5. Noções base de conservação da natureza e biodiversidade.
6. Ameaças à Biodiversidade
7. Importância da biodiversidade para o funcionamento dos ecossistemas marinhos
8. Extinções: registos e causas
9. Perda, fragmentação e degradação de habitats
10. Sobrexploração de recursos
11. Espécies exóticas e invasivas
12. A era Antropocénica
13. A conservação da Natureza
14. A conservação da natureza e biodiversidade: principais teorias e modelos.
15. Principal legislação nacional e internacional
16. As áreas protegidas portuguesas
17. A conceção, gestão e ordenamento de áreas protegidas.
18. Alterações climáticas e ecossistemas marinhos
19. Ameaças, consequências e vulnerabilidades
20. Medidas mitigadoras e de adaptação
21. Movimentos globais para a proteção do clima e dos ecossistemas marinhos

O estudante deve escolher um dos 3 Grupos Opcionais (1, 2 ou 3 ) e tem de realizar, obrigatoriamente, as 3 Unidades Curriculares que fazem parte desse grupo

Consulte a composição dos Grupos Opcionais na tabela seguinte:

GRUPO OPCIONAL 1

GRUPO OPCIONAL 2

GRUPO OPCIONAL 3

O estudante deve escolher um dos 3 Grupos Opcionais (1, 2 ou 3 ) e tem de realizar, obrigatoriamente, as 3 Unidades Curriculares que fazem parte desse grupo

Consulte a composição dos Grupos Opcionais na tabela seguinte:

GRUPO OPCIONAL 1

GRUPO OPCIONAL 2

GRUPO OPCIONAL 3

1. Introdução à Bioinformática.
2. Fontes de informação biológica: bases de dados biológicas
3. Análise e comparação de sequências:
   3.1. Ferramentas de software para análise e predição de sequências biológicas.
   3.2. Padrões, alinhamentos, perfis, motivos.
4. Análise estrutural de macromoléculas.
5. Genomas, proteomas, transcriptomas.
6. Biologia de sistemas.
7. Aplicações: filogenia, biotecnologia, ecologia, farmacêutica, entre outras.

1. Aspetos da qualidade associados ao pescado: bactérias, vírus, biotoxinas, aminas biogénicas, parasitas e produtos
   químicos;
2. Deterioração do pescado. Alterações pós morte do pescado;
3. Controlo de qualidade pelos métodos microbiológicos tradicionais: amostragem; testes microbiológicos; critérios
   microbiológicos;
4. Higienização nos estabelecimentos do pescado: qualidade da água, limpeza e desinfeção; higiene do operador;
5. Metodologia HACCP: conceitos e princípios; etapas do procedimento HACCP (implementação); validação e
   verificação dos planos de HACCP;
6. Métodos de avaliação da qualidade do pescado: métodos sensoriais; métodos físicos, químicos e microbiológicos.

[P1] – Avaliação e monitorização de recursos pesqueiros
[P1.1] As principais características da actividade pesqueira – pesca artesanal versus pesca industrial
[P2] – Modelos de produção para avaliação de recursos
[P3] – Pontos de referência biológicos e medidas de regulamentação
[P4] – Medidas de gestão e conservação de recursos pesqueiros
[P4.1] Selectividade das artes de pesca e modelos de selectividade
[P5] – Análise de casos de estudo
[P6] – Bioeconomia e ética em pescas

1. Introdução à aquacultura
2. Principais categorias de produção
3. Estado atual da produção em aquacultura em Portugal e no Mundo
4. Perceção do consumidor e estratégias de mercado
5. Noções básicas de produção de invertebrados e de vertebrados
6. Noções básicas de produção de macroalgas e de microalgas
7. Qualidade da água para cultivos em água doce e em ambiente marinho
   7.1. Sistemas de recirculação da água em aquacultura.
8. Sistemas de produção em aquacultura
   8.1 Sistemas abertos e fechados
   8.2 Sistemas intensivos, semi-intensivos e extensivos
   8.3 Maternidade, pré-engorda e engorda
9. Conceitos básicos de nutrição em aquacultura
10. Seleção de espécies
11. Estruturas e equipamentos
12. Principais desafios e oportunidades associados ao setor aquícola

1 Serviços e Funções dos Ecossistemas Marinhos
1.1. Importância da biodiversidade e serviços de ecossistema

2. Poluição e contaminação
   2.1. Definição de contaminação e poluição marinha e estado dos mares
   2.2. Medição de alterações ambientais
3. Matéria orgânica e nutrientes
   3.1. Eutrofização
   3.2. Consequências das descargas orgânicas nos ecossistemas
4. Alterações climáticas e poluição biológica
   4.1. Acidificação dos oceanos
   4.2. Efeitos da acidificação dos oceanos
   4.3. Espécies invasoras
5. Contaminantes e poluentes globais
   5.1. Hidrocarbonetos derivados do petróleo
   5.2. Metais Pesados
   5.3. Poluentes orgânicos persistentes
6. Contaminantes e poluentes emergentes
   6.1. Compostos disruptores endócrinos; veterinários e farmacêuticos; nano-partículas
7. Ecotoxicologia marinha
   7.1. Conceitos gerais e avaliação de risco ambiental
   7.2. Testes de toxicidade: efeitos letais e subletais; misturas
   7.3. Biomarcadores e bioindicadores
   7.4. Bioacumulação
   7.5. Ligação de efeitos do gene à população

O estudante deve escolher um dos 3 Grupos Opcionais (1, 2 ou 3 ) e tem de realizar, obrigatoriamente, as 3 Unidades Curriculares que fazem parte desse grupo

Consulte a composição dos Grupos Opcionais na tabela seguinte:

GRUPO OPCIONAL 1

GRUPO OPCIONAL 2

GRUPO OPCIONAL 3

1. Produção de cadeias tróficas
   1.1 Bases biológicas e tecnologia de cultivo
   1.2 Cultivo de microalgas
   1.3 Cultivo de zooplâncton
2. Cultivo de invertebrados marinhos
   2.1 Bases biológicas e tecnologia de cultivo
   2.2 Cultivos de anelídeos poliquetas
   2.3 Cultivo de equinodermes
   2.4 Cultivo de moluscos bivalves
   2.5 Cultivo de crustáceos
3. Cultivo de peixes
   3.1 Bases biológicas e tecnologia de cultivo
   3.2 Tecnologia de cultivo de peixes marinhos
   3.3 Cultivo de salmonídeos e enguia
   3.4 Cultivo de novas espécies
4. Tecnologia de cultivo em sistemas de recirculação (RAS) e multitróficos integrados (IMTA)

1. Produção de cadeias tróficas
   1.1 Bases biológicas e tecnologia de cultivo
   1.2 Cultivo de microalgas
   1.3 Cultivo de zooplâncton
2. Cultivo de invertebrados marinhos
   2.1 Bases biológicas e tecnologia de cultivo
   2.2 Cultivos de anelídeos poliquetas
   2.3 Cultivo de equinodermes
   2.4 Cultivo de moluscos bivalves
   2.5 Cultivo de crustáceos
3. Cultivo de peixes
   3.1 Bases biológicas e tecnologia de cultivo
   3.2 Tecnologia de cultivo de peixes marinhos
   3.3 Cultivo de salmonídeos e enguia
   3.4 Cultivo de novas espécies
4. Tecnologia de cultivo em sistemas de recirculação (RAS) e multitróficos integrados (IMTA)

1. Case-studies de aplicações da Biologia Marinha
2. Análise de projetos de investimento na área das Ciências do Mar
3. Desenvolvimento de Soft-skills através da elaboração de relatórios, apresentações orais, e desenvolvimento de
   outros materiais.

O estudante deverá escolher entre realizar o Estágio ou Projeto.

• Estágio

C 1. Inserção em ambiente empresarial/organizacional

• Projeto

C1. Elaboração de um plano de trabalhos de um Projeto
1.1. Pesquisa bibliográfica associada ao tema do trabalho
1.2. Planeamento das etapas a desenvolver no projeto
1.3. Organização do trabalho laboratorial
1.4. Elaboração do projeto experimental em grupo.
C 2. Escrita de relatório final. Análise e discussão
C 3. Apresentação e discussão final do projeto